Diseño computacional
La computación puede ser de gran ayuda en diferentes fases de los procesos de identificación u optimización de compuestos activos, en áreas tan diversas como farmacia, veterinaria, cosmética, biotecnología, agroquímica, alimentación funcional, etc.
Estas actividades pueden subdividirse globalmente en dos tipos, modelización molecular y química-informática, según si el tipo de información de partida para generar los modelos depende de la estructura tridimensional de un receptor o a partir del conocimiento previo de hits o compuestos activos.
Ofrecemos nuestros servicios a entidades que quieran acelerar sus procesos de I+D y reducir los costes de desarrollo. Nuestras metodologías permiten reducir el número de candidatos a adquirir o sintetizar para los consiguientes ensayos biológicos, e identificar compuestos novedosos con perfiles únicos. Nuestra colaboración puede desempeñar además un rol fundamental en áreas en las que las nuevas reglamentaciones limitan extraordinariamente o incluso prohíben directamente los ensayos tradicionales con animales (por ejemplo en cosmética).
Algunas de las líneas en las que trabajamos con regularidad son las siguientes
COMPUESTOS ACTIVOS
Identificación de nuevos compuestos activos (por ejemplo, identificación de “hits” inhibidores de dianas terapéuticas).
REPOSICIONAMIENTO
Reposicionamiento de fármacos para su uso en áreas terapéuticas diferentes a las conocidas.
«DE NOVO»
Diseño computacional “de novo” de compuestos potencialmente activos, y diseño basado en fragmentos moleculares (“fragment-based design”).
FARMACOFÓRICOS
Identificación de análogos no estructurales (farmacofóricos) de compuestos activos, y por tanto no protegidos por patentes previas.
PREDICCIÓN
Predicción de propiedades farmacocinéticas y toxicológicas (ADME-T, de «Absorción, Distribución, Metabolismo, Excreción y Toxicidad»)
ELABORACIÓN HIPÓTESIS
Elaboración de hipótesis sobre mecanismos de acción.
QUIMIOTECAS
Diseño de quimiotecas focalizadas, es decir librerías de estructuras químicas construidas mediante la selección de los mejores compuestos tras aplicar nuestras metodologías. Aplicando estos modelos a grandes quimiotecas computacionales se pueden obtener colecciones de diversidad química.
CRIBADO VIRTUAL
Evaluación computacional de grandes colecciones de moléculas, para la identificación de aquellas que tienen una mayor probabilidad de ser activas o tener las propiedades fisicoquímicas o farmacocinéticas deseadas.
Preguntas frecuentes
¿Qué servicios ofrece ProtoQSAR?
ProtoQSAR es una empresa especializada en modelos QSAR y predicciones toxicológicas in silico para apoyo regulatorio (REACH, CLP, ICH, K-REACH, etc.). Ofrecemos estudios personalizados (QSAR, SAR, read-across, priorización de compuestos…) y ProtoPRED®, nuestra plataforma de predicción molecular con más de 60 modelos de toxicidad, propiedades fisicoquímicas, ecotoxicidad y ADME.
Trabajamos con compañías de los sectores farmacéutico, químico, cosmético, agroquímico y consultoras regulatorias. También impartimos cursos prácticos en QSAR y normativa regulatoria.
¿Cuánto tiempo se tarda en obtener los resultados?
Con ProtoPRED®, las predicciones son instantáneas. En estudios a medida, el plazo depende del nº de compuestos y del alcance y suele oscilar entre semanas y hasta ~2 meses. Al finalizar los estudios ofrecemos informes listos para ser entregados a los organismos regulatorios (QPRF).
¿Qué software utiliza ProtoQSAR para desarrollar sus modelos?
Usamos modelos QSAR propios integrados en ProtoPRED®, nuestra plataforma de predicción molecular con más de 60 modelos de toxicidad, propiedades fisicoquímicas, ecotoxicidad y ADME.
En estudios a medida, recurrimos a herramientas de terceros como QSAR Toolbox y VEGA cuando no existe un modelo interno equivalente en ProtoPRED, garantizando la aceptabilidad por parte de los organismos regulatorios.
¿Se aceptan los modelos QSAR de ProtoQSAR en REACH, CLP, ICH u otras normativas?
Sí, nuestros modelos siguen las directrices de la OECD y se documentan con QMRF y QPRF por predicción, lo que facilita la aceptación regulatoria, disminuyendo la necesidad de ensayos experimentales.
Además, contamos con ejemplos de aceptación regulatoria de nuestros modelos por parte de distintas autoridades.
¿ProtoQSAR participa en proyectos colaborativos?
Sí, colaboramos en consorcios europeos (HORIZON, IHI…), nacionales (Torres Quevedo, NANOTECH…) y convocatorias regionales (IVACE, AVI…).
En ProtoQSAR, junto a Moldrug y ProtoQSAR Italy (nuestras empresas asociadas), buscamos socios industriales y académicos.
¿Tienes alguna propuesta? Escríbenos a bd@protoqsar.com.
¿Cuánto cuesta hacer una predicción con ProtoPRED o un estudio a medida?
ProtoPRED® funciona con un sistema de tokens y ofrece descuentos por volumen: cuantos más tokens se adquieren, menor es el coste por predicción. También disponemos de licencias anuales para equipos que utilizan la herramienta de forma intensiva, la licencia sale rentable a partir de 200 predicciones anuales.
En el caso de estudios a medida, el precio depende del nº de compuestos, los endpoints implicados y el nivel de documentación regulatoria requerido.
→ Solicitar opciones de precios de ProtoPRED / Solicitar presupuesto para un estudio a medida
¿Ofrecéis soporte científico y acompañamiento regulatorio?
Sí. Además de generar modelos y predicciones QSAR, ofrecemos soporte científico y regulatorio: diseño de la estrategia in silico, validación e interpretación de resultados y elaboración/revisión de QMRF y QPRF para que las predicciones estén adaptadas a las guías de la OCDE y/o a los marcos legales aplicables para estar conforme con los requisitos de las autoridades.
Nuestro equipo de regulatoria estará encantado de ayudarte. Escríbenos a regulatory@protoqsar.com.
¿Cómo se gestiona la confidencialidad y la protección de datos?
En ProtoPRED®, la privacidad y protección de datos están integradas en tu cuenta. Desde la página de usuario (Reports data) puedes activar Data Privacy para borrar de forma irreversible todos los resultados de tu predicción, conservando únicamente el modelo utilizado y la fecha.
También ofrecemos la posibilidad de firmar un NDA (acuerdo de confidencialidad) que garantiza la seguridad de la información, el cumplimiento de privacidad y la protección de datos.
Contacta con nosotros y nuestro equipo te asesorará en todo lo que necesites
Estamos aquí para ayudarte. No dudes en ponerte en contacto con nosotros para recibir asesoramiento personalizado y resolver cualquier duda que tengas. Nuestro equipo está disponible para ofrecerte la mejor atención.
Dirección
Parque Tecnológico de Paterna
Carrer de Nicolau Copèrnic 6,
1er Piso, Oficina 8
46980 Paterna (Valencia)
